MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015574	ATA	2	6	851208	851213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015574	ATTT	2	8	851232	851239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015574	TTTTA	2	10	851250	851259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015574	T	7	7	851307	851313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015574	TAAC	2	8	851326	851333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_015574	TAAT	2	8	851342	851349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015574	T	7	7	851386	851392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015574	TAA	2	6	851408	851413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015574	TTC	2	6	851436	851441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_015574	AT	3	6	853898	853903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015574	CT	3	6	853923	853928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_015574	C	8	8	854037	854044	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5013	NC_015574	T	10	10	854808	854817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015574	ATT	2	6	854822	854827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015574	ATA	2	6	854891	854896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015574	T	6	6	856638	856643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015574	AAT	2	6	856653	856658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015574	T	8	8	856671	856678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015574	AATT	2	8	856679	856686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_015574	ATA	2	6	856695	856700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015574	CT	3	6	856720	856725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_015574	AGT	2	6	856780	856785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015574	GTT	2	6	856804	856809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015574	TAA	2	6	856856	856861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015574	TATT	2	8	856912	856919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015574	TA	3	6	857125	857130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_015574	TCA	2	6	857139	857144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_015574	GTA	2	6	857149	857154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015574	TAA	2	6	857164	857169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015574	T	6	6	857186	857191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015574	TAA	2	6	857210	857215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015574	A	6	6	857217	857222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015574	TTA	2	6	857246	857251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015574	ATA	2	6	857295	857300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015574	AGGATA	2	12	857313	857324	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015574	A	7	7	857342	857348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015574	A	7	7	857353	857359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015574	AGTAA	2	10	857362	857371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015574	A	6	6	857389	857394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015574	TTAATC	2	12	857413	857424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5041	NC_015574	GCA	2	6	857479	857484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015574	AAT	2	6	857593	857598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015574	ATT	2	6	857614	857619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015574	TA	4	8	857705	857712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015574	TAT	2	6	857788	857793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015574	ATTC	2	8	858626	858633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_015574	ATTC	2	8	858644	858651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_015574	AAT	2	6	858653	858658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015574	AATA	2	8	858685	858692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015574	TATT	2	8	859410	859417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015574	T	6	6	859416	859421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015574	TAAT	2	8	859438	859445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015574	ATT	2	6	859458	859463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015574	GAATAA	2	12	859485	859496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015574	A	7	7	859502	859508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015574	TAAA	2	8	859544	859551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015574	T	6	6	859567	859572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015574	GTAGT	2	10	859735	859744	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015574	CCGG	2	8	859792	859799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_015574	ATT	3	9	859863	859871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015574	AAC	2	6	859875	859880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015574	T	7	7	859896	859902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015574	TGT	2	6	859936	859941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015574	TTA	2	6	859958	859963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015574	TGG	2	6	859972	859977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015574	TA	3	6	859998	860003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015574	TTA	2	6	860032	860037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015574	ATC	2	6	860124	860129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015574	AT	3	6	860212	860217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015574	A	6	6	860236	860241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015574	GGA	2	6	860278	860283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015574	GAA	2	6	860294	860299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015574	TGT	2	6	860334	860339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_015574	TAAACT	2	12	860449	860460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5078	NC_015574	AAG	2	6	860638	860643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015574	ATAA	2	8	860739	860746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015574	AT	3	6	860768	860773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015574	TGG	2	6	860775	860780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015574	GGA	2	6	861027	861032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015574	TGT	2	6	861521	861526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015574	AAT	2	6	862802	862807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015574	TTA	2	6	862815	862820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015574	CCT	2	6	863029	863034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_015574	ATTT	2	8	863072	863079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015574	ATT	2	6	863198	863203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015574	TA	3	6	863214	863219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015574	A	7	7	863219	863225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015574	AT	3	6	863238	863243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015574	AATT	2	8	863309	863316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015574	ATA	2	6	863372	863377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015574	ACT	2	6	863397	863402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5096	NC_015574	ATA	2	6	863450	863455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015574	TTTG	2	8	863468	863475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015574	TTA	2	6	863502	863507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015574	ATT	2	6	863523	863528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015574	GCT	2	6	863565	863570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_015574	A	8	8	863605	863612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015574	ATT	2	6	863621	863626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015574	TACT	2	8	863669	863676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_015574	TTTAG	2	10	863714	863723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015574	T	7	7	863767	863773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015574	GTG	2	6	863838	863843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015574	T	7	7	863898	863904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015574	A	9	9	863906	863914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015574	ATT	2	6	864022	864027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015574	AAT	2	6	865086	865091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015574	T	6	6	865134	865139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015574	T	7	7	865141	865147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015574	TTA	2	6	865227	865232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015574	TTA	2	6	865238	865243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015574	ATTTA	2	10	865266	865275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015574	TCATAA	2	12	865299	865310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5117	NC_015574	TTG	2	6	865378	865383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015574	T	8	8	865941	865948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015574	AT	3	6	865976	865981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015574	TTA	2	6	865987	865992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015574	ATT	2	6	866020	866025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015574	T	6	6	866024	866029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015574	T	8	8	866033	866040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015574	TAA	2	6	866100	866105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015574	A	6	6	866113	866118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015574	TAA	2	6	866134	866139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015574	CT	3	6	866160	866165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_015574	TGGT	2	8	866199	866206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015574	TGG	2	6	866234	866239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015574	CAC	2	6	866252	866257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_015574	TAAA	2	8	866332	866339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_015574	TTC	2	6	866808	866813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_015574	AGA	2	6	866832	866837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_015574	TAA	2	6	866840	866845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_015574	AGA	2	6	866848	866853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_015574	TTTAA	2	10	866854	866863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_015574	T	6	6	866866	866871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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